.cram امتداد الملف
نوع الملفCompressed Alignment File
المطور | EBI |
فئة | Data Files |
شكل | Binary |
CRAM
تنسيق ملف محاذاة مضغوط تم تطويره بواسطة EBI ، محطة خارجية لمختبر البيولوجيا الجزيئية الأوروبي ؛ يخزن تسلسل الحمض النووي القصير محاذاة القراءة الناتجة عن محاذاة القراءة القصيرة مثل BWA و BBMap و BLAT
يشبه تنسيق ملف CRAM تنسيق ملف Binary Alignment / Map (BAM) ولكنه يتميز بضغط أفضل للملف وتنسيق حاوية حاوية ثنائية العمود معاد هيكلتها. مع زيادة وحدات تخزين البيانات في مجال البرامج الوراثية ، تم تصميم تنسيق CRAM لتقليل طباعة بيانات المحاذاة على القرص.
المحاذاة القصيرة للقراءة هي عملية فك تشفير من أين يأتي التسلسل في الجينوم. قد يكون هذا صعبًا لأن الجينوم المرجعي كبير إلى حد ما ولا تبحث دائمًا عن التطابقات الدقيقة في الجينوم المرجعي. يتم استخدام محاذاة القراءة القصيرة للبحث عن تسلسلات هائلة للمطابقات والمباريات القريبة. نظرًا لأن التسلسلات كبيرة جدًا ، فإن الضغط الذي توفره تنسيقات مثل CRAM ضروري للحفاظ على أحجام الملفات قابلة للإدارة.
Windows |
|