Integrated Genome Browser
| نص (اعتبارا من 2016-06-29)
|
9 |
| منصةs | |
| رخصة | Open Source |
| فئة | Scientific |
| مزيد من المعلومات
(زيارة موقع الناشر)
|
مراجعة البرمجيات
وظائف رئيسية
- يدعم تنسيقات الجينوم المختلفة مثل GenBank و FASTA
- تفاعل مع البيانات من خلال تكبير / تحريك الرسوم المتحركة
- قم بالوصول إلى الجينوم وتحميله من مواقع QuickLoad
- تحويل البيانات إلى أشكال بيانية مختلفة
- مشاركة البيانات مع المتعاونين من خلال Dropbox
- تثبيت المكونات الإضافية للحصول على وظائف إضافية
متصفح الجينوم المتكامل (IGB) هو برنامج مفتوح المصدر يستخدم لعرض واستكشاف مجموعات البيانات الجينية الكبيرة. يمكنك عرض تنسيقات البيانات المختلفة ، والتفاعل مع البيانات ، وإنشاء الرسوم البيانية ، وحفظ المعلومات الخاصة بك كصور ، ومشاركة البيانات الخاصة بك مع المتعاونين.
يتيح لك IGB عرض البيانات من التعليقات التوضيحية والتسلسلات المتوافقة. يدعم البرنامج مجموعة متنوعة من التنسيقات مثل FASTA و BAM و BEDGRAPH و BigWIG و Cytoband و GenBank. يمكنك أخذ البيانات وتحويلها إلى مجموعة متنوعة من أشكال الرسم البياني بما في ذلك الرسوم البيانية غير المتطابقة لإبراز اختلافات البيانات والرسوم البيانية العميقة لإظهار التغطية. يمكنك أيضًا التفاعل مع البيانات الخاصة بك من خلال تكبير / تصغير رسوم IGB المتحركة.
يمكّنك IGB من الوصول إلى الجينوم وتحميله من مواقع QuickLoad ، والتي تعد أنظمة بسيطة من الأدلة والتسلسلات وملفات البيانات الأخرى لأغراض التصور. يوفر IGB وظائف متقدمة مع دعم البرنامج المساعد لإضافة وظائف وأتمتة سير العمل من خلال استخدام البرامج النصية. يمنحك IGB أيضًا ميزات متقدمة لمشاركة بياناتك ، سواء كان نشرها في صورة JPEG أو PNG أو SVG عالية الجودة أو تخزين البيانات في Dropbox لمنح المتعاونين الوصول إلى مشروعك.
تستخدم في المقام الأول من قبل الباحثين الجامعيين وعلماء الأحياء وأخصائيي المعلومات الحيوية. يوفر أدوات متقدمة لفتح مجموعة متنوعة من تنسيقات بيانات الجينوم ، وتصور البيانات كرسومات بيانية مختلفة ، ومشاركة البيانات مع المتعاونين. لسوء الحظ ، يعتمد البرنامج على منح التطوير المستمر ، مما يعني أن دعم التطبيق قد يتوقف في أي وقت. ومع ذلك ، لا يزال Integrated Genome Browser برنامجًا قابلاً للتخصيص وقابل للتخصيص للمستخدمين الذين يتطلعون لاستكشاف وتحليل بيانات الجينوم الخاصة بهم.
تم التحديث: 29 يونيو 2016
▶ ملحقات الملفات الأخرى المستخدمة Integrated Genome Browser 9
| أنواع الملفات المدعومة | |
|---|---|
| .BED | UCSC BED Annotation Track File |
| .DAS | DeltaMaster Analysis Session |
| .GB | GenBank Data File |
| .FAS | FASTA Sequence File |
| .FASTA | FASTA Sequence File |
| .FA | FASTA Formatted Sequence File |
| .USEQ | USeq Genome Data File |
| تنسيقات الملفات ذات الصلة إضافية |
|---|